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Land

Die ganze Insel wird von stark zergliederten Gebirgsketten durchzogen, die mit dem Mount Kinabalu im Nordosten von Sabah mit 4 101 Metern die größte Höhe erreichen. In den Bergen entspringen viele Flüsse, von denen die wichtigsten Rajang, Kapuas, Barito und Mahakam sind.

Das Klima ist tropisch, die Jahresdurchschnittstemperaturen liegen bei etwa 26 °C und die Jahresniederschläge bei 4 064 Millimetern. Die stärksten Niederschläge fallen zwischen Oktober und Mai während des Nordostmonsuns.

Die dominierende ursprüngliche Vegetation, der tropische Regenwald, wurde insbesondere im Südosten und Osten der Insel durch Brandrodung großflächig zerstört; ehemals von Regenwald bestandene Flächen sind heute zumeist von Grasfluren bedeckt. Verheerende Waldbrände, durch die u. a. die auf Borneo heimischen Orang-Utans in ihrer Existenz gefährdet wurden, gab es in den Jahren 1982/83 und 1997. Zur Säugetierfauna Borneos gehören außerdem Nasenaffen, Koboldmakis, Tupaias und Riesengleitflieger. Im Regenwald wachsen über 50 Nutzholzarten.